Ozon a jeho vedlejší produkty (jako je hydroxyl) mají nejsilnější baktericidní a virucidní účinek, mohou být užitečné při prevenci šíření infekčních chorob,
Experimenty ukazují, že stejné koncentrace ozonu ničí bakterie a viry 600 až 3000krát více než chlor.
Pokud je koncentrace ozonu 1 mg / l, inaktivace stolice coli trvá pouze 5 sekund, se stejnými koncentracemi chloru k dosažení stejného účinku potřebujete 15 000 sekund.
Ozon je mezinárodně uznávaný ekologický zelený fungicid nezpůsobí žádné sekundární znečištění životního prostředí, chlor reaguje s organickou hmotou ve vodě za vzniku různých chlorovaných organických sloučenin, jako je chloroform a trichlormethan, tyto látky jsou uznávanými mutageny způsobujícími rakovinu. Když lidé plavou, tyto toxické látky jsou absorbovány tělem (tělo ve vodě může absorbovat 500 ml vody za hodinu).
Chlorované organické sloučeniny ve vodě také stimulují oči a pokožku a způsobují červené oči a kožní vyrážky.
